Home » События » Обучающие семинары с приглашенными учеными

Обучающие семинары с приглашенными учеными

В рамках международного сотрудничества и стимулирования развития биоинформатики в России, в лаборатории геномной биоинформатики с 7 по 17 ноября прошли обучающие семинары с приглашенными учеными.

Джоан Понтиус, ведущий специалист-исследователь в области  биоинформатики в  SRA International, на протяжении 10 дней вела для сотрудников  лаборатории обучающие семинары  о современных компьютерных средствах, используемых в cфере биоинформатики.

Среди тем, освещенных на семинарах, можно выделить следующие :

  • Основы работы в командной строке
  • Программы для выравнивания последовательностей ДНК — BLAST, EPCR. Метод лучших взаимных соответствий для поиска синтенных участков
  • Написание скриптов на Perl, Bioperl
  • Маскирование повторов ДНК
  • Аннотация и предсказание генов (GMAP)
  • Платформа GBrowse для создания геномного браузера
  • Контроль выполнения геномных проектов: идеи и ПО

Денис Ларкинn, занимающийся изучением эволюции хромосом, селекцией млекопитающих и других видов  с помощью новейших  методов молекулярной геномики и биоинформатики в Университете г. Абериствис,   посветил свои семинары обсуждению следующих тем:

  • Проблема сравнения геномов разных видов — анализ синтении
  • Программы для анализа и визуализации синтении: Synteny Tracker и Evolution Highway