Research Project Portals

Лада Антонова 

Помощник руководителя

Я занимаю должность личного помощника руководителя Центра с января 2018 года. Помимо выполнения поручений доктора С.Д. ОБрайена, я осуществляю перевод документов, координацию взаимодействия научного коллектива со службами СПбГУ, организацию локальных и выездных мероприятий и научных семинаров, помощь в подготовке научных экспедиций, организацию приема иностранных и отечественных гостей Лаборатории, и др.

В 2015 году я окончила бакалавриат Факультета социологии Санкт-Петербургского государственного университета по направлению «Общая социология», а в 2017 г. там же получила степень магистра международной социологии по программе «Европейские общества». Кроме того, в 2016 году я получила диплом переводчика с английского языка по программе «Переводчик в сфере профессиональной коммуникации» на Факультете иностранных языков СПбГУ.

 

 

 

 

 

 

 

Научно-исследовательские проекты Центра

Проект Российские геномы

Санкт-Петербургский государственный университет

Проект Российские геномы

Гены являются основной «инструкцией» для функционирования клеток, из которых состоит организм человека. Гены входят в состав геномной ДНК. Более 99% последовательностей ДНК у всех людей идентично. Однако не существует двух людей, имеющих полностью одинаковую последовательность ДНК, за исключением однояйцевых близнецов. Индивидуальные отличия последовательностей ДНК называются генетическими вариациями. Они объясняют некоторые физические различия между людьми и частично объясняют, почему у одних людей возникают такие болезни, как рак, диабет, астма, депрессия и пр., в то время как у других этих болезней не бывает. На возникновение упомянутых выше заболеваний могут оказывать влияние такие факторы, как диета, физические упражнения, курение и загрязнение окружающей среды, что затрудняет точное выяснение, какие именно гены влияют на болезни.

GWATCH is a web-based genome browser designed to automate analysis, visualization and release of data from genome-wide association studies (GWAS) and whole genome sequence association studies of genetic epidemiological cohorts.

GWATCH - web-based genome browser for genome-wide association studies

GWATCH is a web-based genome browser designed to automate analysis, visualization and release of data from genome-wide association studies (GWAS) and whole genome sequence association studies of genetic epidemiological cohorts. For any association study, GWATCH allows cataloging and viewing of significant statistical results of association tests (p-values, odds ratios, hazard ratios and others) for single or multiple variants (SNP, indels, CNV), for single or multiple tests.

Genome-based Mycobacterium Tuberculosis Variation Database

Исследование геномов клинических штаммов возбудителя туберкулеза - Mycobacterium tuberculosis, посвящено поиску маркеров, ассоциированных с клиническими и микробиологическими характеристиками патогена на основе данных полногеномного секвенирования. Сотрудниками Центра создана база данных геномных вариаций штаммов M. tuberculosis, распространенных по всему миру, объединяющая генетические, клинические, микробиологические и географические данные (GMTV). Исследования ведутся совместно с Санкт-Петербургским НИИ фтизиопульмонологии, Санкт-Петербургским НИИ эпидемиолонии и микробиологии им. Пастера, и поддержаны грантами РФФИ и СПбГУ.

Анализ взаимодействия опухоли и микроокружения на уровне одиночных клеток при фолликулярной лимфами

Фолликулярная лимфома

Проект направлен на изучение фундаментальных основ взаимодействия опухоли и микроокружения при фолликулярной лимфоме, злокачественной опухоли лимфатической системы. Несмотря на эффективность терапии первой линии, обеспечивающей подавление роста опухолевых клеток, это заболевание остается неизлечимым и у 20% пациентов наблюдается рецидив в течение первых двух лет терапии. Понимание механизмов развития резистентности и поиск ранних прогностических маркеров остается одной из актуальных задач.

Assembly, Annotation, and Comparative Analysis of Apomictic Boechera Species Genome

Сборка, аннотация и сравнительный анализ геномов апомиктичных видов Boechera

Руководитель проекта В.Б.Брюхин

Apomixis is asexual way of plant reproduction through seeds, which could be found in more than 400 plant species representing almost 40 families. It is believed that apomixis evolved independently in several taxa from sexual ancestors. Apomixis could be considered as a developmental variation of sexual reproduction in which some steps are lost, reduced, deregulated or desynchronized (Fig.1). The main features of gametophytic apomixis are:

  • Avoidance of meiosis (apomeiosis);
  • Embryo formation via parthenogenesis;
  • Functional endosperm develops either autonomously or pseudogamously (central cell fertilized by sperm cell).

Феодосий Григорьевич Добржанский, советский и американский генетик российского происхождения, энтомолог, один из основателей синтетической теории эволюции.

Больше информации о ...

Руководители Центра

Анастасия Самсонова

Профессор, руководитель Центра

Публикации

Александр Канапин

Профессор, зам. руководителя Центра

Публикации

Стефан Джеймс О'Брайен 

Главный научный сотрудник, научный консультант  

Стефан Джеймс О’Брайен руководил лабораторией геномного разнообразия Национального ...

Лабораторные новости

На сайте СПбГУ опубликована статья о проекте. Статья посвящена научной публикации сотрудников Центра.

27 сентября 2019 (пятница) в 14:00: Dr. Kirill Vinnikov from Hawaii University (USA) and head of the lab at the Far Eastern Federal University (Vladivostok) "Exome sequencing of non-model species"