Миссия

 

Новости

Поздравляем профессора Стефана О’Брайена с присвоением звания Полного члена Академии наук США!

Полный текст сообщения о присуждении здесь

Летняя школа Института биоинформатики приглашает участников!

23–28 июля в пригороде Санкт-Петербурга пройдет Летняя школа, организованная Институтом биоинформатики. К участию приглашаются студенты, аспиранты и молодые специалисты биологических и технических специальностей, интересующиеся биоинформатикой и желающие развиваться в этой области. Основная тема этого года — биоинформатика в исследованиях рака. Студентов ждут лекции от ведущих ученых, интенсивные практики, доклады от более опытных участников и работа >>>

Краткий ретрит-отчет

Краткий ретрит-отчет проходил 1 февраля 2018 в Центре им. Ф.Добржанского, в котором приняли участие представители Администрации Университета и сотрудники Центра. Были представлены доклады Стефана О’Брайена, Владимира Брюхина, Павла Добрынина и Дмитрия Полева. Кроме того выступали Сергей Аплонов, Валерий Пузырей и Геннадий Васильев.

« Older Entries

 

Новости фондов

Congratulation

2015.12.15 По итогам совместного конкурса исследовательских проектов РФФИ – Департамент Науки и Технологии Правительства Индии 2015 г. в котором приняли участие 145 проектов, одним из 50-ти победителей стал проект «Закрепление гибридной силы посредством бесполого размножения — генетический скрининг, направленный на индукцию апомиксиса у цветковых растений». Руководитель проекта — в.н.с. Лаборатории «Центр геномной биоинформатики им. Ф.Добржанского» >>>

 

Пресса о нас

Поздравляем!

В Российской Академии Наук состоялись выборы новых членов Академии. Иностранным членом Академии по Отделению биологических наук избран О’Брайен Стефан Джеймс (США) — физико-химическая биология. Это заслуженное достижение Руководителя Лаборатории «Центр Геномной Биоинформатики им Т. Добржанского. Поздравляем! https://indicator.ru/article/2016/10/28/pobediteli-vyborov-v-ran-inostrannye-chleny/

Ролик про Центр Геномной Биоинформатики им Ф.Г.Добржанского на канале Санкт-Петербург

Телекананал Санкт-Петербург сделал 15 минутный фильм про «Центр геномной Биоинформатики им Ф.Г.Добржанского» и его проекты. Смотрите фильм на канале youtube

Лаборатория “Центр Геномной Биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского” СПбГУ была основана в 2011 году на средства мегагранта Министерства науки и образования Российской Федерации для государственной поддержки научных исследований, проводимых под руководством ведущих мировых ученых в российских государственных высших образовательных и научных учреждениях.

Основной задачей являлось создание лаборатории, в которой специалисты в области генетики и биоинформатики, студенты и научные сотрудники будут разрабатывать и использовать инновационные компьютерные методы для сборки геномов живых организмов, их аннотации, обнаружения генов, выявления их функций, с последующим внедрением полученных результатов в здравоохранение, сельское хозяйство и охрану природы.

Решение этих задач невозможно без широкого сотрудничества с международным научным сообществом в области генетики, биоинформатики и компьютерной биологии. Результатом такого сотрудничества является создание доступных биоинформатических инструментов для анализа геномов в популяциях и применения новейших достижений компьютерной биологии для решения проблем молекулярной генетики.

После завершения мегагранта в 2015 году в лаборатории “Центр геномной биоинформатики им. Ф. Г. Добржанского” сформировались несколько научных направлений, каждое из которых продолжает своё развитие.

Основным проектом лаборатории в настоящее время является проект "Российские геномы", который поддерживается и финансируется администрацией СПбГУ. Главной целью проекта «Российские геномы» является создание открытой компьютерной базы данных, содержащей анонимную информацию о полногеномных последовательностях нескольких десятков групп жителей различных регионов России, чьи предки являются коренными жителями данного региона в нескольких поколениях, а также описание вариаций в геноме у этих групп, определение особенностей, влияющих на распространение заболеваний и создание информационной базы медицински-значимых геномных вариантов, характерных для населения России, что станет основой для разработки принципов персонализированной медицины будущего.

Не менее значимыми для лаборатории являются проекты:

  • Сравнительная геномика животных. В данном проекте геномика и биоинформатика используются для понимания эволюции генов и генных семейств, повторяющихся элементов, архитектуры генома и естественного отбора у разных видов животных, а также влияния отбора на биологическое разнообразие видов.
  • Геномика для сохранения видов. Применение геномики для разработки метрик и прикладных аспектов сохранения и контроля численности популяциий диких и исчезающих видов.
    Проекты по геномике животных осуществляются при поддержке Российского Фонда Фундаментальных Исследований (РФФИ) и Российского Научного Фонда (РНФ). В настоящее время в Лаборатории изучаются и имеются полногеномные сиквенсы 25 видов млекопитающих и 17 видов немлекопитающих животных.
  • Исследование геномов клинических штаммов возбудителя туберкулеза - Mycobacterium tuberculosis. Исследования посвящены сравнительной гномике M. tuberculosis и поиску маркеров, ассоциированных с клиническими и микробиологическими характеристиками патогена. Сотрудниками лаборатории создана база данных геномных вариаций штаммов M. tuberculosis, распространенных по всему миру, объединяющая генетические, клинические, микробиологические и географические данные (GMTV). Исследования ведутся совместно с Санкт-Петербургским НИИ фтизиопульмонологии и поддержаны грантами РФФИ и СПбГУ.
  • Разработка методов исследования геномов с помощью ассоциативной генетики с использованием математической статистики; создание 3-х мерного геномного браузера, ориентированного на поиск полногеномных ассоциаций между известным фенотипом в кагорах пациентов и генетическими вариациями.
  • Сборка и аннотация высоко гетерозиготных геномов растений de novo, выявление закономерностей и поиск генов, ответственных за переключение с полового размножения (амфимиксис) на бесполое (апомиксис), исследование генов, ассоциированных с апомиксисом , находящихся под эволюционными отбором. Проект проводится при поддержке Российского Фонда Фундаментальных Исследований (РФФИ).